V nedotčené oblasti se mohou skrývat i méně obvyklé lesní druhy.
Ochránci pátrají v okolí Padrťských rybníků a nádrže Pilská pomocí moderních ultrazvukových detektorů. Letní monitoring netopýrů je jedna z věcí, které se v dřívější vojenské oblasti provádět nemohly.
V širší oblasti Brd odborníci vědí o čtrnácti druzích netopýrů a v lidmi takřka nedotčené chráněné krajinné oblasti by mohli objevit i vzácné lesní druhy. Sbírají také data o úkrytech netopýrů a o doupných stromech. V těch mohou podle Plzeňského deníku hnízdit i různé druhy ptáků.