Podíl nedoplatků na vyměřených daních se v ČR pohybuje okolo 3,6 procenta, což je podle Ministerstva financí úroveň srovnatelná se zeměmi EU. Zlepšení výběru daní je prioritou nového ministra financí Jiřího Rusnoka.
Nedostatky v českém daňovém systému kritizují mezinárodní finanční instituce. Vyzývají, aby ČR důrazněji bojovala proti daňovým únikům a šedé ekonomice. Lepší systém vybírání daní by navíc pomohl napravit zhoršující se deficit veřejných financí.