Kvalita vody na přírodních koupalištích se postupně horší, podle posledních dostupných informací z měření hygieniků je na několika místech regionu kvalita natolik zhoršená, že je nevhodná ke koupání pro vnímavé jedince. Zákaz koupání ale zatím hygienici nevydali. Informace o čistotě vody uvádějí na svých internetových stránkách.
Podle posledních zatím dostupných měření z konce června a začátku července je zhoršená kvalita vody na Klatovsku na koupalištích Hnačov a Valcha a v Plzni na Velkém Boleveckém rybníku a v jezírku Košutka. Lehce zhoršená voda je také na přehradě Hracholusky a na Domažlicku v Horšovském Týně - Podhájí a v Babylonu.
Podle hrázného hracholuské přehrady Jiřího Kašpara se kvalita vody hlavně u hráze a na Radosti výrazně zhoršila v posledních dnech. Průhlednost je tam nyní kolem 1,5 až dvou metrů, voda je úplně zelená. "Zezelenalo to velmi rychle za dva poslední dny," konstatoval hrázný. Dál po přehradě, u železničního mostu a na Butově, je voda tmavě hnědá, průhledná do dvou metrů.