Česká republika vstupuje 31. prosince 2007 do Schengenského prostoru, kde je zaručeno všem osobám právo překračovat vnitřní hranice na kterémkoliv místě a kdykoliv bez nutnosti procházet hraniční kontrolou. Návštěvníci Šumavy musí ale dát dodržovat všechny zákazy vstupu.
V rámci Schengenského prostoru založeného na svobodě pohybu budou na hranicích České republiky se všemi sousedními státy, tj. s Německem, Polskem, Slovenskem a Rakouskem odstraněny překážky (zátarasy, závory) bránící plynulému provozu na hraničních přechodech silničních, železničních i na stezkách pro pěší a cyklisty a na letištích, kde by měly být kontroly odstraněny v roce 2008. Neomezené překračování hranic v Schengenském prostoru umožnilo České republice rozšíření Schengenského informačního systému.
Je proto třeba připomenout, že Schengenská úmluva nemění podmínky ochrany přírody v chráněných územích, podléhajících národnímu zákonu o ochraně přírody a krajiny. Zřejmě jediným pozitivním důsledkem uzavření hraničního pásma České republiky v druhé polovině 20. století byl fakt, že zdejší přírodní hodnoty zůstaly zachovány v naprosto unikátním stavu – a to i z celoevropského hlediska. Jedná se o zvláště chráněná území, a to čtyři národní parky, přibližně 14 chráněných krajinných oblastí a řadu maloplošných národních přírodních rezervací. Řada z těchto území byla právě pro své hodnoty evropského významu zahrnuta také do soustavy Natura 2000. "V Národním parku a Chráněné krajinné oblasti Šumava tedy i nadále zůstává v platnosti zákon o ochraně přírody a krajiny. To znamená, že i v rámci Schengenského systému zůstává v I. zónách, národních přírodních rezervacích a klidových oblastech v NP a CHKO Šumava v platnosti zákaz vstupu mimo značené turistické cesty – lhostejno, zda jde o území přímo na státní hranici nebo ve vnitrozemí," připomíná mluvčí šumavského národního parku Radovan Holub.
