Kolapsu kolaborativního aplikovaného výzkumu se obává Rada vysokých škol. Její předseda Jakub Fischer upozornil v dopisu pro vicepremiéra pro vědu Pavla Bělobrádka (KDU-ČSL), ministryni školství Kateřinu Valachovou (ČSSD) a ministra průmyslu Jana Mládka (ČSSD), že vědci nemají na výzkum peníze. Po vyčerpání programu ALFA totiž neexistuje žádná náhrada.